2013年1月23日，中国农业机械化协会一届三次理事会审议并通过了成立农机科技分会等三个分会，分会秘书处设在农业农村部南京农业机械化研究所。分会拥有会员单位36家，分布于全国农业工程相关的高校、科研院所、企业等单位内。分会围绕中国农业机械化协会的主要任务，坚持“组织带头、服务行业、参会自愿、协会主导”的原则，在农业机械化科研开发、技术推广、教育培训、学术交流、国际合作等方面，发挥组织带头作用。

主要职责：农机科技分会业务范围包括宣传贯彻国家发展农机化科技的方针政策和法律法规，协助政府有关部门完善农机化科技行业自律；组织开展农机化科技创新、人才培养和学科发展等规划的咨询论证工作；组织开展农机化科技需求调研，举办新机具和新技术演示活动；组织开展农机化科技国际国内学术交流和学术研讨活动；组织开展农机化科技成果转让等中介服务工作；组织开展农机化技术人员新技术培训活动；承办政府部门及中国农业机械化协会的有关工作。